Olá Dado,
Então... o software padrão da empresa aqui é Windows... eu tenho uma partição com Ubuntu na minha máquina mas tenho preguiça de ficar reiniciando o PC toda hora, ehehehhehehe. Só não propus a migração para Linux aqui porque o pessoal do rh/administrativo usa muitos softwares do governo que são todos em windows e nem penso em fazê-los rodar em Wine ou algo parecido.
Anyway...
Não tive problemas com alinhamento não... talvez pela simplicidade da minha aplicação ouuu porque a toolchain que eu uso já fez as modificaçõe necessárias. A que venho usado chama-se YAGARTO e no site deles tem 80% de tudo que venho usando.
Inclusive no sábado você comentou sobre OpenOCD... a forma que venho usado OpenOCD baseia-se no tutorial que eles tem disponível no site. O endereço é
http://www.yagarto.de.
Ahhh... estou usando o J-TAG do James Lynch para debugar. Simples e barato.
Espero ter ajudado de alguma forma. Qualquer coisa que precisar é só falar.
Abraço,
Eduardo Garcia
http://www.eduardogarcia.eng.br